കേരളത്തിൻ്റെ ഭരണത്തിൻ്റെ മേൽ ആധിപത്യം സ്ഥാപിക്കാൻ മുസ്ലിം സമുദായത്തിൻ്റെ വർദ്ധിച്ചുവരുന്ന ജനസംഖ്യയെ ഉപയോഗിക്കുകയാണെന്ന പരാമർശത്തെ തുടർന്ന് കൊച്ചിയിൽ എസ്. എൻ. ഡി. പി. യോഗം ജനറൽ സെക്രട്ടറി വെള്ളാപ്പള്ളി നടേശൻ ഞായറാഴ്ച കടുത്ത വിമർശനം നേരിട്ടു. തിരിച്ചടി ഉണ്ടായിരുന്നിട്ടും, “കാന്തപുരം (എ. പി. അബൂബക്കർ മുസ്ലിയാർ) എനിക്ക് നേരെ കുന്തം എറിഞ്ഞാലും ഞാൻ സാമൂഹിക നീതിക്ക് വേണ്ടി സംസാരിക്കുന്നത് തുടരും” എന്ന് പറഞ്ഞുകൊണ്ട് സാമൂഹിക നീതിക്ക് വേണ്ടി വാദിക്കുന്നത് തുടരുമെന്ന് വിട്ടുവീഴ്ചയില്ലാത്ത നടേശൻ പ്രതിജ്ഞയെടുത്തു.
നടേശന്റെ പരാമർശത്തെ ശക്തമായി അപലപിച്ച വിമർശകരിൽ പ്രതിപക്ഷ നേതാവ് വി. ഡി. സതീശനും ഉൾപ്പെടുന്നു. എസ്എൻഡിപി യോഗം നേതാവിൻ്റെ പരാമർശങ്ങൾ ഭിന്നിപ്പിക്കുന്നതും ശ്രീ നാരായണ ഗുരുവിൻ്റെ പഠിപ്പിക്കലുകൾക്ക് വിരുദ്ധവുമാണെന്ന് സതീശൻ പറഞ്ഞു.
മുസ്ലിം സമുദായത്തെക്കുറിച്ച് താൻ നടത്തിയ വിവാദ പരാമർശങ്ങൾക്ക് പിന്നിൽ മുഖ്യമന്ത്രി പിണറായിയാണെന്ന് നടേശൻ ആരോപിച്ചതിനെ തുടർന്നാണ് വിവാദങ്ങൾ ഉടലെടുത്തത്.
കേരളത്തിലെ ഒരു പ്രധാന രാഷ്ട്രീയ സംഘടനയായ ഇന്ത്യൻ യൂണിയൻ മുസ്ലിം ലീഗ് ഈ ആരോപണങ്ങളിൽ ആശങ്ക പ്രകടിപ്പിച്ചിട്ടുണ്ട്.